Intorno al 2160 l'umanità avviò una colonizzazione aggressiva dei pianeti del Confine di Skyllian, una regione occupata e sviluppata decenni prima dai Batarian. Nel 2171, questi ultimi chiesero al Consiglio di considerare il Confine una "zona d'interesse batarian". Il Consiglio però si oppose, affermando che i mondi non occupati della regione potevano essere colonizzati liberamente dagli Umani.
In segno di protesta, i Batarian chiusero le proprie ambasciate sulla Cittadella e terminarono qualsiasi relazione diplomatica con il Consiglio, diventando di fatto una specie ribelle. Quindi fomentarono una guerra nel Confine fornendo denaro e armi alle organizzazioni criminali della zona, incitandole ad attaccare le colonie umane.
Le ostilità raggiunsero il culmine con "l'Assalto di Skyllian" del 2176, in cui una flotta di pirati e schiavisti appoggiata dai Batarian attaccò la colonia di Elysium, capitale umana della regione. Nel 2178 l'Alleanza si vendico sferrando un violento assalto contro la luna di Torfan, usata da tempo come base logistica dei gruppi criminali finanziati dai Batarian. In seguito i Batarian ripiegarono nei propri sistemi, e oggi vengono visti di rado nello spazio della Cittadella.
Quando arrivarono per prime sulla Cittadella, le Asari scoprirono anche i Custodi, una specie di insetti docili e dai molteplici arti che sembra esistere solo per riparare e mantenere in funzione la grande stazione prothean.
I primi tentativi di comunicare o studiare i Custodi non diedero alcun risultato, e oggi è addirittura illegale ostacolare o impedire le loro attività. Essendo del tutto innocui, i Custodi sono diventati praticamente invisibili per tutte le specie della Cittadella. Loro stessi restano indifferenti nei confronti delle altre specie, anche se hanno dimostrato una certa tendenza ad aiutare i nuovi arrivati ad integrarsi a bordo della stazione.
Il loro numero sembra rimanere sempre costante, anche se nessuno ha mai scoperto come fanno a riprodursi. Alcuni ritengono che siano degli androidi creati nel cuore della Cittadella, un luogo sconosciuto e inaccessibile.
Gli Elcor sono una specie della Cittadella originaria di Dekuuna, un pianeta ad altissima gravità. Il loro corpo di enormi dimensioni è sorretto da quattro potenti arti inferiori che garantiscono una maggiore stabilità. Gli Elcor si muovono sempre lentamente, forse perché abituati a vivere in un ambiente in cui ogni caduta può essere letale. Ciò ha influenzato anche la loro mentalità, rendendoli estremamente cauti e moderati.
Gli Elcor parlano con un tono di voce grave e monotono. Quando comunicano tra loro usano odori, movimenti imprecettibili e infrasuoni subvocali per ricreare particolari sfumature semantiche. consapevoli che questa loro particolarità può creare spiacevoli malintesi con le altre specie, gli Elcor sottolineano spesso il loro stato d'animo con aggettivi molto chiari e definiti.
L'elevata gravità di Dekuuna ha impedito la formazione di catene montuose. Gran parte del pianeta non è altro che una sconfinata distesa pianeggiante in cui gli Elcor preistorici si muovevano in piccoli clan tribali. Ancora oggi gli Elcor preferiscono gli spazi aperti, motivo per cui i lunghi viaggi interstellari li rendono inquieti e nervosi.
I Geth sono una specie umanoide di IA collegate in rete. Furono creati circa 300 anni fa dai Quarian per ricoprire il ruolo di operai e soldati a basso costo. Non appena i Geth mostrarono i primi segni di autocoscienza, i Quarian decisero di sterminarli tutti. Ma i Geth riuscirono a sconfiggere i loro creatori. Questa vicenda portò a una repressione legale e sistematica di tutte le intelligenze artificiali presenti nella comunità galattica.
I Geth possiedono un'intelligenza collettiva assolutamente unica, e ogni individuo ha un istinto animale appena abbozzato. All'aumentare del loro numero e della loro vicinanza, l'intelligenza di ogni soggetto migliora notevolmente. Quando sono in gruppo possono ragionare, analizzare la situazione e studiare tattiche come qualsiasi altra specie organica.
Lo spazio dei Geth si trova ai confini del Braccio di Perseo, oltre i pericolosi Sistemi Terminus. Il Velo di Perseo, una densa "nebulosa oscura" formata da gas e pulviscolo, separa il loro territorio dal resto della galassia.
Gli Hanar sono una specie della Cittadella nota per la sua eccessiva cortesia. Parlano in modo preciso e scrupoloso, offendendosi se l'interlocutore usa un linguaggio considerato improprio. Gli Hanar più a contatto con le altre specie seguono dei corsi speciali per imparare a "sopportare" i termini rozzi e imprecisi usati dagli alieni.
Tutti gli Hanar hanno due nomi: il nome "manifesto" è noto a tutti, mentre quello "spirituale" viene usato solo nelle relazioni più intime e confidenziali. In una conversazione con qualcuno che conosce solo il loro nome manifesto, non si riferiscono mai a se stessi parlando alla prima persona singolare, cosa che sarebbe considerata egoistica. In queste occasioni preferiscono utilizzare espressioni come "il sottoscritto" o usare la forma impersonale.
Kahje, il loro pianeta natale, è coperto quasi interamente da ocenai e orbita intorno a una stella bianca. A causa dell'elevato calore, la superficie è sempre oscurata da una spessa coltre di nubi. Molti Hanar venerano i Prothean, le cui rovine sono sparse ancora oggi su tutto il pianeta, e pensano che siano stati loro a donargli la parola.
I Krogan si sono evoluti in un ambiente ostile e pericoloso. Nel loro pianeta natale gli animali predatori sono sempre stati la principale causa di morte, alemno fino all'invenzione delle armi da fuoco.
Quando i Salarian entrarono in contatto con loro, i Krogan stavano cercando di sopravvivere ai postumi di una guerra nucleare che aveva devastato il pianeta. I Salarian li elevarono culturalmente, insegnandogli a utilizzare e costruire tecnologie più moderne. In cambio, i Krogan furono invitati a combattere nella Guerra dei Rachni.
Non essendo più costretti a vivere nelle condizioni proibitive del loro mondo natale, i Krogan si moltiplicarono in gran numero. Iniziarono quindi a colonizzare i pianeti vicini... nonostante fossero già abitati. la Rivolta dei Krogan durò quasi un secolo, fino a quando i Turian non usarono un'arma biologica sviluppata dai Salarian nota come "genofagia" per annientare la resistenza Krogan.
La genofagia consente solo una gravidanza su mille di andare a buon fine. I Krogan, oggi in via di estinzione, nutrono un profondo risentimento verso tutte le altre specie, ma in particolare nei confronti dei Turian.
Stanziata aldilà del portale galattico di Omega 4 dei Sistemi Terminus, la misteriosa specie dei Collettori si vede così di rado, che molte società galattiche la considerano soltanto un mito. In realtà, i Collettori sono degli esseri insettoidi e bipedi di dimensioni umane, e ricordano dei grossi coleotteri alati. Sono una potenza della galassia davvero temibile, responsabile dello sterminio di centinaia di migliaia di persone.
I Coleotteri generano a sé un campo di stasi permanente, creando i loro temuti campi di forza rossi. In battaglia cercando di mantenere la posizione e si affidano ai loro poteri biotici d'attacco e alla loro energia quasi illimitata. Sono stati identificati diversi tipo di Collettori bipedi, inclusi servitori, guardiani, fanatici, assassini e artiglieri.
Collaborando insieme, i Collettori hanno imprigionato intere città dentro campi di stati. Sebbene non esistano prove scientifiche certe sulla sorte delle vittime imprigionate, si ritiene che queste vengano raccolte per sperimentazioni scientifiche e conversioni neuro-biologiche.